スペクトルをY軸dBで表示したとき、Y軸スケールの下限より小さいスペクトルの位相は強制的に０度と処理しています。よって、スペクトル（Mag)の値が小さいところはカットされてしまい（０を表示）、リスト表示の個数が少なくなります。(図がきれいではありませんがご了承ください）

　

取説6-1-2章「Ｙ軸スケールを任意に変更する」機能を使ってＹ軸の下限を変更してください。